За свое существование дом сменил немало владельцев. К конку 19 столетия он находился в плачевном состоянии, а в некогда жилых помещениях располагался винный склад. В 1888 г. по инициативе губернатора Н.М. Баранова, было принято решение об организации в доме исторического музея. Дом отремонтировали, базируясь не столько на исторических документах (их не было), сколько на собственных представлениях о принципах древнерусского каменного зодчества.
Первый нижегородский музей принял на хранение 1300 предметов, но для музея дом был тесен. Коллекцию перенесли в башни Нижегородского кремля. Некоторое время здесь располагалась общественная читальня и другие учреждения, в 20 веке в доме жили люди, в годы войны в подвале оборудовали убежище ПВО. В 60-70х годах дом Чатыгина дождался, наконец, заслуженной научной реставрации. В помещениях отреставрированного дома разместилось Горьковское областное отделение Всероссийского общества охраны памятников истории и культуры. С начала 1990-х годов в доме помещалась реставрационная организация «Наследие», а подвальное помещение использовалось под кафе, где проходили встречи нижегородского рок-клуба.